内容前景：找到宝藏的我们，在旅馆却遭到了不明男人的偷袭，到手的宝藏不翼而飞。我跟着追踪信号来到了男人和另外的人的交易地点，并且在途中联系了在当地巡逻的佐藤警官，原来那名幕后操纵者是石恒岛国际度假村策划项目总经理-赫尔穆斯·约翰，他和他的同伙正在准备着一场惊心动魄的第三次世界大战的邪恶计划！得到宝藏后的赫尔穆斯·约翰很快联系了专机，虽然在一个广场上浪费了很多时间，但最后还是让他插翅逃走，而我趁所有人不注意时也登上了飞机……这场浩劫般的前兆还未落幕……真正看透真相以及对手法了如指掌的是一个外表看似小孩，智慧却过于常人的名侦探-柯南！
（上篇-黑色里的银翼）
‘嗖嗖’，飞机底盘上的仓库室由于底盘的打开而寒风刺骨，空气急流形成的冷风迎面扑来，蹲在仓库室里的江户川早已冷得直抖索。柯南按住 伸缩腰带 中间的按钮，腰带弹出足球，柯南将膨胀适当的足球塞住舱门，才堵住了空气进入飞机。柯南颤巍巍地朝驾驶舱挪移着身体，走到驾驶舱，柯南看见了副驾驶座上的 赫尔穆斯·约翰，柯南举起左手上的手表麻醉枪，对准了正在驾驶飞机的机长，‘哔’的一声，麻醉剂射中了机长，几秒种后，机长陷入麻醉状态，赫尔穆斯·约翰 转身看到了柯南，说：“小鬼，你还真是阴灵不散啊！”柯南微微一笑，说：“呵呵，约翰先生，作为侦探的我可不能够就这么放了你。”‘轰’的一声，直升机大幅度地摆动了一下，赫尔穆斯·约翰立刻坐到驾驶座上，才有惊无险地使直升机回到轨道上，赫尔穆斯·约翰 说：“这是侦探的本能吗？为什么明知道有危险却还要硬拼？”‘哔’，柯南用 手表麻醉枪 射中了 赫尔穆斯·约翰 的脖子，赫尔穆斯·约翰 本能地喃喃：“可恶，你……”慢慢地，麻醉剂发生了作用，渐渐麻醉了赫尔穆斯·约翰，虚弱的赫尔穆斯·约翰 乏力地说：“小子，你、你、你究竟是……何方神圣！？”柯南调动着自动驾驶状态，回头微笑着说：“呵，江户川……哦不，工藤新一！我是个高中生侦探。”“高中生吗？”赫尔穆斯·约翰看着小学生模样的柯南，喃喃：“侦探呐……‘tw-49’，先辈的伟业我还没有…还没有完成呢，称霸世界的宏图还未完成……工、工藤新一，你！！！”说着说着，赫尔穆斯·约翰 进入了麻醉状态。
几分钟后。柯南调整完直升机的自动驾驶状态后，放松地躺在副驾驶座上，长叹了口气，右手拿出了小兰的照片，喃喃道：“兰~……”“注意！注意！本机剩余燃料已不足百分之十五！请立刻降落！”语音系统发出了红色警报，柯南猛得一愣，拿起耳机呼叫：“请告诉我离我现在的坐标最近的跑道！”一家航空公司收到了柯南发出的呼叫信号，说：“这里是石恒岛航空机场总部！请该机立刻减速！”“注意、注意，导航系统异常！飞机自动驾驶功能损坏！飞机处于离地面6500米……6000米……”直升机的语音系统发出预告，柯南仔细检查着飞机的系统，喃喃：“可恶！燃油已经耗尽了！石恒岛？万不得已的话，只好……”
石恒岛机场。“看！”一个工作人员指着高空喊道，夜空中出现了一个红点，越来越近、越来越快！工作人员急忙联系着那架直升机，说：“这里是石恒岛航空机场总部！直升机立刻改变飞行轨道！”突然‘磁磁’的声音，通讯截断。只见红点越来越近，清晰地看见一架直升机横冲直撞地朝石恒岛机场飞来，眼看飞机就要撞上机场的高楼，柯南用力握住驾驶杆，使尽向上拉。柯南从昏迷的赫尔穆斯·约翰 手中拿走宝藏-钻石，喃喃：“这颗钻石应该就是他们用来研制高核辐能量的！从而抵制世界各国的核武器的。”说完将钻石插入了能量箱内，‘嗖’的一声，钻石随着一道紫色光芒化解为了驱使直升机飞行的能量。
“柯南……！”昏迷中的小兰猛地惊醒，睁开眼，看见一架直升机向机场撞去，小兰担忧地喃喃着：“柯南……”毛利小五郎立刻坐着计程车赶往机场，并命令警察迅速疏散所有居民。同时，妃英里也赶了过去。
“呀……！！”柯南使尽浑身解数拉动驾驶杆，直升机猛烈地撞击了高楼，顿时电光火石、硝烟弥漫，但并没有停止疯狂的飞行。直升机内。柯南已经头破血流，伤痕累累，不禁回忆起几年前小兰说过：“新一，要是在乎的话，向海前进！”“海。”柯南看着机场附近的海域，喃喃：“兰。”机场附近的公路、大桥早已聚集了大批警察，高木涉说：“佐藤警官，再不射击，直升机就要撞击海域了！”佐藤美和子 焦急地说：“柯南还在里面！不能开枪！柯南……”“柯南！”小兰奔跑着过来，坠落的直升机上，柯南看着机场旁边的公路上的小兰，微微一笑，喃喃：“小兰，再见了……”小兰眼睁睁看着直升机冲撞大海，掀起几丈高的海浪，渐渐残骸沉入海底，直到海面上平静。小兰流出了眼泪，仿佛心如刀绞般的刺痛。
也许，生命就此完结了。
“小兰！”毛利小五郎和妃英里来到大桥。“爸爸……？”小兰已经悲伤痛疾，大家望着远处的大海掀起一番番浪潮，这个夜晚从危险中过度到了黎明的到来……“都怪你！”妃英里埋怨说道：“好端端的度什么假！”“我……”毛利小五郎也深感自责，喃喃：“要不是我，大家也不会来这里；要不是我，英里也不会受到鲨鱼的攻击；要不是我，小兰也不会受伤；要不是我，大家也不会卷入这场命案引起的风波；要不是我，那个小鬼也就不会……”
（中篇-地狱决死）
海域的某个区域。“额，我这是在哪儿……？”柯南睁开朦胧的双眼，发现自己躺在一艘充气船上，旁边躺着的是 赫尔穆斯·约翰 和 机长，柯南站了起来，看见船头站着一个人，那人穿着银白色的外装，带着高高的帽子，“你、你是……”柯南说，“小鬼，你可醒了。”那人转身说，柯南大吃一惊：“k、k……怪盗基德！”基德摘下帽子鞠了一躬，说：“bingo！答对了，怎么样？感谢我吧。”柯南仔细回想了一下：
直升机冲进海域，顿时机体由于压强被挤得粉碎。然而在撞击海面的那一刹那，昏迷中的江户川柯南被人抱了起来，从直升机上飞走了，那人就是-怪盗基德。基德乘着 滑翔翼翱翔在夜空中，直到降落在了这艘充气船上
柯南喃喃：“原来是这样啊…”基德说：“噢，小鬼，忘了告诉你了。可惜那颗钻石被你浪费用掉了，所以说这把剑我就收下了！”基德说着便拿出了那把从深海里的战舰里找到的宝剑，柯南才省悟到，摸着自己身上，果然那把剑不见了，只剩下了那些关于军事文件，基德说：“关于军事嘛，我不感兴趣，所以说那些纸张我还是留给你。呵呵…”说完从船头向后一跃，准确无误地站在了滑翔翼上，柯南跑到船头，大声喊道：“基德！！！”“呵呵呵，后会有期。”基德说着便从东方飞去，直到消失在了视野。柯南拿出 侦探徽章，呼叫阿笠博士：“阿笠博士，我是工藤，现在我在石恒岛附近的海域上，转告给小兰她们说我没事。”阿笠博士听了高兴地说：“哎呀！新一啊。你没事就好。我马上通知毛利。”说完便打了毛利小五郎的电话，说：“毛利先生，刚才新一……哦不，是柯南打来电话说他没事。”小兰抢过电话激动地说：“博士，是真的吗？柯南，他没事！”得知江户川柯南还活着的消息，警方立刻采取了海面搜寻，果然在石恒岛附近一片海域找到了一艘充气船的踪迹。
“柯南！”小兰下了飞机急忙跑到柯南身边，抱紧柯南念道：“还好没事……这真是太好了……”柯南也抱紧了小兰，喃喃：“兰~，对不起，让你担心了。”小兰看着柯南，问：“柯、柯南你叫我什么……哦没关系啦，呵呵。”柯南连忙掩饰说：“不是的啦！是新一哥哥救了我，还托付我转告小兰姐姐。”小兰看着一望无际的大海，喃喃：“真的是……新一吗？新一……”柯南看着小兰的脸，自言自语说：“对不起小兰，现在我还不能告诉你我的身份！没有完全铲除掉那个组织的话，我是绝不会罢休的！！”
几人都回到了石恒岛的旅店里。坐在沙发上的毛利小五郎闷闷不乐，小兰问：“爸，你怎么了？”小五郎忧愁地喃喃：“小兰，你怪我吗？”小兰微笑地说：“不，从来都没有过。因为你是我爸爸，我们都相信着你。”“小、小兰……”毛利小五郎没有再说什么。柯南将那些从深海带回来的关于一战时期德国的军事文件交给了佐藤美和子，说：“现在世界各国还有妄想复兴战争的狂徒分子。只是我们还没有足够的证据罢了。”佐藤警官说：“我会通知目暮警官和上级的！相信会给联邦一个具体的报告的。那么柯南，你们就继续度假吧，我们就先走了。”说完开车离开了石恒岛去往米花町。
医院。赫尔穆斯·约翰 和那名驾驶直升机的机长，躺在病床上。毛利一行人来到了医院。一双暗中的眼睛正注视着他们，“谁！”柯南大喊，所有人转身四处查看，妃英里问：“柯南，怎么了？”“我隐约感觉到有人在监视我们。而且已经有很久了！”毛利小五郎大喊：“谁啊！出来啊！有胆子就站出来。”没人答应，“哎，这里是医院！安静点！”医护人员说道。那个暗中的黑影，口中喃喃道：“名侦探-毛利小五郎啊，呵呵呵呵…”
一天。‘嗖！’一声，一支银色鳞片插在毛利小五郎的房间，一早醒来，大家都吓坏了。毛利小五郎看了看鳞片上的刻纹，鳞片上刻印道：‘若想人不知，除非己莫为。三年的羁绊即将要冲破结界的封印了！署名：k’柯南看了看，问：“叔叔，你认识银色鳞片的的主人吗？”只见毛利小五郎一副心急如焚的样子，口中喃喃：“也许认识，这种气息好熟悉。却不晓得到底是谁。”柯南心想：“到底，信中的内容是什么呢？‘若想人不知，除非己莫为’…到底，他的目的是……”‘叮咚！’门铃响了，原来是服务员，服务员说：“毛利先生你好，从医务室派我转告给您，约翰先生已经度过危险，现在仍在医务室静养。”“哦，知道了。谢谢你了。”毛利小五郎说道，关上了门，“怎么了？”妃英里问，毛利小五郎说：“赫尔穆斯·约翰基本康复，现在还在静养。真不知道你这小鬼当时在直升机上对他做了什么，竟然昏迷了这么久！”说着将目光转向了柯南，柯南笑着，自言自语：“呵呵，当然要给他打麻药了，否则‘tw-49’就要行动了。”柯南再次沉思：“这银色鳞片到底是谁寄来的？他会不会是我在医务室感觉到的那个人？如果是，那么，他一定还在这附近！”柯南跑了出去。
来到餐厅3楼-赫尔穆斯·约翰的办公室。柯南看了看门牌号，说：“这不是当时我窃听赫尔穆斯·约翰的那个房间吗？既然来了，就去瞧瞧吧。”说着，柯南悄悄溜进了房间，仔细找着重要文件，这时‘叮铃铃’的电话声，柯南吓得一身冷汗，只好用变声蝴蝶结模仿 赫尔穆斯·约翰的声音，接了电话，说：“我是约翰。”电话另一端的声音是一个男人，男人用德语说：“约翰先生，东西到手了吗？”“他说的是德语？”柯南自言自语：“他就是上次那个提出‘tw-49’的人！‘那个东西’难道是指钻石？”柯南继续模仿说：“嗯，还没有，那个侦探太没用了，目前为止，一战时期赫尔穆斯·约翰内斯·毛奇遗留下来的宝藏还没有找到。”“该死！‘tw-49’已经准备就绪了！就等你了。我已经安排间谍潜入你的周围了，别做对不起国家的事情！”电话里的男人说完挂断了电话，柯南松了口气，说：“可恶，‘tw-49’还未停止！这群狂战分子还在准备发动战争，怎么办？”柯南离开了房间回到旅馆。
柯南看着那片银色鳞片，心想：“银色鳞片的主人到底和毛利小五郎有着什么关系。‘若想人不知，除非己莫为’的含义指的是什么？‘三年的羁绊’，三年？三年发生在叔叔身上的事情我应该都知道啊，怎么会一点头绪也没有？”毛利小五郎仔细回想，喃喃：“该不会是……”这时‘嗖’的一声又一支银色鳞片飞了进来，柯南捡起鳞片望窗外看，那个人早就无影了。毛利小五郎看着银色鳞片，念到：“红桃5、方块a、黑桃5、梅花9。署名：i”“什么意思？”柯南想了想，突然猛的一下，打叫：“难道是……红桃5指的是‘毛利小五郎’的‘五’；黑桃5指的是‘妃英里’的英文名字‘ kisakieri’其中的‘e’，指的是26个英文中第5个的‘e’；梅花9指的是小兰姐姐的‘兰’子，因为‘兰’的谐音与英文‘nine（英文9）’很相像。”毛利小五郎听了说：“那么方块a指的是……”柯南连声道：“工藤新一。‘工藤新一’中‘一’在扑克牌中代表a。”毛利小五郎目瞪口呆，喃喃：“难道说，那个人要……复仇的意思吗？”柯南拿着银色鳞片，喃喃：“没错，这是恐吓口语的决战函，‘与毛利小五郎的pk’”毛利小五郎笑着说：“呵呵，真如目暮警官说的‘我到了哪儿，哪儿就有案件’，真是的，这次没想到发生在自己身上了。呵呵！尽管来吧，银色鳞片！”
（下篇-第4个目标）
毛利一行人走在街上，身后总跟着一个穿黑色衣服的男人。柯南停住了脚步，回头指着那个人，说：“大叔，跟了这么久了吧。”男子不做声色，只是点着烟，毛利一行人又继续走了，男人喃喃：“呵呵，毛利…你逃不掉的。”
走在海边。‘嗖’一声，一张银色鳞片划过毛利小五郎的脸颊，擦边而过，钉在海边的栏杆上，毛利小五郎愣了一下，只见被鳞片划破的伤口流出了丝丝血印，柯南拔出鳞片，念到：“‘囊中之物的红桃5’，这、这是…”毛利小五郎擦了擦血迹，说：“已经来了。呵呵，再怎么说我也是个侦探呐，怎么能被这种目中无人的小人给暗算了呢？”说完淡定地向前方吼道：“寺冈学长，你可出来了。”“寺冈？！”所有人听到这个名字时都是一副震惊的样子，柯南回想着：“寺冈？有这个人吗？”这时一个脚步声渐渐靠近，从楼道慢慢走来一个左脸有一道疤痕的男子，柯南恍然大悟：“是他！寺冈…”男子走到众人面前，口中喃喃：“毛利老弟，好久不见啊。”男子把头抬了起来，竟然是寺冈圣米（出现在《名侦探柯南》tv版第66集《第三个指纹杀人事件》。寺冈圣米：原警视厅二科组长），寺冈圣米指着脸上的疤痕说：“这道疤痕可都是托你的福啊，毛利老弟。”“我…？”毛利小五郎哑口无言，寺冈圣米顿时愤怒地埋怨说：“你晓得这几年我在里面是怎么过来的吗？在我被带回警局后，那伙强盗集团依旧向我勒索，还说我杀了松山要我偿命，结果！结果就杀死了我太太！因为毛利小五郎，这都是你所赐的！要不是你非要破了那次的案子，我太太也就不会遇害。再说，我为民除害杀了松山也不正是为了警局吗！而且我原本给松山的信用卡和现金里都装有定位器，为的是在松山和他的同伙们回合后能够将他们一网打尽，至于那部我临时准备的手枪，是为了作防护措施而准备的！那伙强盗集团原本可以跪落法网，没想到我和松山回合后把钱可信用卡交给他后，他却说集团已经散伙，我精心布置的计划全盘散乱了！于是我就开枪杀了松山！但是，那伙人竟然又重新组合了起来，得知了松山的死后，他们就决定要离开日本……可是，你，毛利小五郎当时没有向外公开是我杀的人，他们也就不会知道是我杀了松山，也就不会找我报仇，我太太她也就不会遇害了！这一切都拜你所赐！”
毛利小五郎浑然不知，柯南喃喃：“我、我竟然不知道这背后。寺冈先生当时…”毛利小五郎说：“学长，所以说你现在的意思是…”寺冈圣米大笑，说：“没错，一命抵一命，哦不，是你们！”说完右手向毛利小五郎扔出一张银色鳞片，“爸爸！”小兰呐喊着，瞬间一个后空翻，踢开了鳞片，寺冈圣米说：“呵呵，空手道啊！来吧！”说着双手拿出6张鳞片，全力进攻，柯南立刻按下 脚力增强鞋 的功率按钮，随之按下 伸缩腰带 中间的按钮，抛出足球，猛力一踢，将所有的鳞片攻克。柯南大喊：“小兰姐姐，保护好叔叔！”说完，跑向了寺冈圣米。拿出 手表麻醉枪，对准了寺冈，‘哔’一声，麻醉剂橐弓而出，柯南自信地喃喃：“好，接下来让你彻底晕倒！”寺冈圣米笑着说：“小鬼，想暗算我！”麻醉剂准确无误地刺中了寺冈圣米的胸部，却被什么弹了出来，柯南大吃一惊，心想：“怎么会…等等，难道说…”柯南看着寺冈圣米的服装，喃喃：“原来如此！我终于晓得你的身份了！”
毛利小五郎大喊：“英里，让开！小兰，保护好你妈！这家伙交给我了！”说完冲了出去，却被柯南拦住，说：“叔叔，你看寺冈先生的身上。”毛利小五郎看了看，推理说：“寺冈学长，想不到啊，出狱不久就如虎添翼了！ss也就是schutzstaffel（德国纳粹党的法西斯特务组织和军事组织的名称）的成员之一啊。”柯南连声说：“你就是那个来日本和 赫尔穆斯·约翰 先生碰头的间谍吧。”“你…怎么知道。”寺冈圣米大吃一惊，柯南摘下眼镜，说：“‘tw-49’，第三次世界大战。”寺冈圣米立刻跑到妃英里的身后，左手拿枪挟住妃英里的脖子，恐吓说：“退后！不然你太太可就归西了！”毛利小五郎着急说：“寺冈！别乱来啊，有什么你冲我来啊！”寺冈笑着说：“呵呵，现在的情况已经不允许我回头了，毛利老弟。”“你……！”毛利小五郎火冒三丈却不知所措。
柯南按下 脚力增强鞋 的按钮，拿出了 太阳能涡旋滑板 ，火力全开，冲向寺冈圣米，几秒后，柯南右手撑起滑板，倒立的腿部一脚踢向寺冈左手的手枪，‘咔’一声，手枪被踢得远远的，踢到了毛利小五郎脚下，寺冈有些着急，哼声说：“小子！别高兴得太早！”说着从左手滑出一把匕首，说：“都说了是特务！身上没有武器怎么行呢？毛利老弟，别轻举妄动，你太太的性命还在我手上！”毛利小五郎举起手枪，对着寺冈，说：“我奉劝你立刻松手。”“叔叔…你可别乱来啊~。”柯南看在眼里，小兰担心地说：“爸，小心呐，妈她…”寺冈圣米笑着说：“哈哈，毛利老弟，你曾经在警视厅里的枪法虽然精准，可是你别忘了，以前你可是开枪射向过妃英里啊，难道你想旧戏重演吗？”妃英里说：“我已经认命了。来吧…”毛利小五郎一身的冷汗，手直颤抖，柯南见情形不对，准备跑向寺冈圣米。
‘嘣’的一声枪响，似乎时间淡定在了这里，飞速的子弹迎刃而出，划破了妃英里的脸颊，从寺冈圣米的左肩穿透而过。“爸爸……”小兰目睹这一切，喃喃道，只见寺冈圣米疼痛地倒地不起，柯南趁机用 手表麻醉枪 瞬间麻醉了寺冈圣米。“英里…”小五郎抱住了虚弱的妃英里，喃喃说：“对不起。”“我知道…每次都是这样吧…”妃英里笑着，最后晕了过去。
十分钟后，目暮十三带领警员赶了过来，说：“工藤老弟说这里有危险，发生了什么？”“新一？”小兰疑问，问：“目暮警官，真的是新一吗？他在哪儿？”“是工藤新一打来的电话。”一旁的佐藤美和子说：“不过奇怪的是工藤用的电话竟然和上次柯南给我打的电话是同一个。”“糟糕！”柯南紧张地喃喃：“由于事态严重，在我用 变声蝴蝶结 模仿我高中生时的工藤新一的声音时，忘记换号码了！”“柯南，你见过新一？”小兰问，柯南紧张地掩饰着：“额~~没有啦！上次新一哥哥接了我的电话现在还没有换给我啦。呵呵！”小兰才打消了念头。
一行人离开了石恒岛，回到了米花亭的毛利侦探事务所。
“妈，现在这么晚了，你就别回去了，就住在这里吧！”小兰说，妃英里拒绝说：“不了，我还有很多案子呢，谁想跟这酒鬼一起过啊！小兰，让开。”坐在沙发上的毛利小五郎不服地说：“切，谁稀罕似的。小兰，让她走。”“爸~！”小兰恳求地说，妃英里说：“算了，小兰，自己照顾好自己，我走了。”说完关上了门，坐计程车回到了律师失事务所。
德国的某军事基地。“该死，寺冈那小子竟然在日本被抓住了！”一个戴着墨镜的男子拍着桌子大喊着，将头转向了一个水晶容器，说：“一百年前的今天，就是大战的爆发，1914年8月…赫尔穆斯·约翰，既然你现在已经是无力回天，那么接下来就交给我吧！哈哈哈！”男人的笑声回荡在基地的每个角落。
……
下集预告：初来熊本，没想到偶遇曾经面熟的人，他究竟是谁？没想到那辆黑色的保时捷也在熊本穿梭，‘熊本的十字架’，琴酒当时和苦艾酒通话是这么说的，‘boss的秘密’究竟是什么，关于aptx-4869、小哀（宫野志保），组织的内幕还有什么不可告人的秘密？下集《柯南》-《与黑暗组织的再会*第一弹·田园宫志》
