内容前景：在两周前，就在金刚石案件（本片第四集-第六集《犯罪的背后》）期间，为了找到基德的老巢，路途中偶遇了琴酒和伏特加，窃听到琴酒和苦艾酒的电话通话，通话提到了‘熊本的十字架’，琴酒的目的就是为了找到田园宫志（本片第一集《来自地狱的魔爪*决裂的星恋》中曾是黑衣组织成员之一田园胜谷的儿子），拿到他从组织里带走的关于‘boss’的机密文件。然而，在这之前，我还有许多不曾了解的内容……层层的谜团、诡异的手法，真正看透其中的真相的是一个外表看似小孩，智慧却过于常人的名侦探-柯南！
（上篇-紫红的傍晚）
“新一，相信我，听到这个震撼的消息后你绝对会高兴的。”阿笠博士激动地说，躺在沙发上的江户川柯南却是一副无精打采地表情，说：“什么啊？”阿笠博士说：“额~是这样的，我有一位在熊本的朋友，他邀请我明天到熊本参加他的作品发布会。”柯南听了，说：“唉，我还以为是什么振奋人心的消息呢，不就是去熊本嘛！有什么大惊小怪的？等一下…”柯南愣了一下：“熊本？太好了，说不定他也在那里，这么一来关于组织的秘密…”柯南立刻转身说：“太好了博士，就去熊本！”阿笠博士感到莫名其妙，自言自语说：“什么嘛，刚才还说没兴趣呢！”
“博士难道不知道他就是这个样子吗？”坐在沙发上看着杂志的灰原哀说，柯南邪笑这说：“呵呵，灰原，或许还能碰到那伙人哦。”灰原哀愣了一下，说：“工藤，你可别暴露了自己 。”柯南说：“当然！在没有将组织完全击垮，我是不会向外公开身份的。”阿笠博士问：“小哀啊，你有兴趣吗？”灰原哀说：“这几天我没什么事可做，就随便你们咯。”阿笠博士听了宣布：“好！就这么决定了，明天早晨我们启程前往熊本市！我马上跟我那位朋友回电话。”
次日早晨，3人开车来到了熊本。
“呀！博士，你终于来了。”一个男子迎面走来，高兴地说：“哈哈，阿笠博士还是老样子，一点没变啊！”阿笠博士下了车，笑着回答：“你不也一样啊，没想到我还能来参加你的作品发布会，这时幸会啊！”男子说：“我哪儿比得上博士你啊！自称是天才发明家的阿笠博士才是真正的人生大赢家啊！”阿笠博士介绍说：“噢，差点忘了介绍了。这位男孩是我远房表亲的儿子-江户川柯南，这边这位也是我的一个亲戚的千金，名叫-灰原哀。”柯南和小哀异口同声道：“叔叔好！”“青梅竹马啊，我最喜欢了。”男子说：“我叫圆谷明，是即将公开各大影院荧幕的超人气科幻大电影《赛罗奥特曼之凤仪赛罗银河篇》的总策划和导演。”柯南一副无奈的样子，喃喃：“什么青梅竹马啊？别瞎说好不好！”圆谷明（圆谷明：日本知名导演，40岁，熊本人）说：“请各位到里面去吧。”
来到大厅。壮丽的灯光五彩斑斓，墙壁上的《赛罗奥特曼之凤仪赛罗银河篇》海报实在震撼，大厅中央的屏幕显示着《赛罗奥特曼之凤仪赛罗银河篇》的预告宣传片，以及大厅两侧的是电影人物展览厅。“喝~！圆谷，你这架势够大的呀！”阿笠博士赞叹说，圆谷明笑着说：“哪里那里，希望这部电影能够有很好的票房。”
一旁的灰原哀喃喃：“都是小孩子看的。”柯南打住说：“别这么说嘛！小孩子，呵呵，你现在不是小孩子吗？我看这部电影倒是蛮不错的，票房应该很好。赛罗哎，英雄！”
下午5点。圆谷明说：“今天时候不早了，要不3位今晚就住在寒舍。”阿笠博士不好意思地答应：“那就拜托你了。柯南呐，你还是打电话给毛利吧，以免他们担心。”“哦，知道了。”柯南回答，转身，拿出变声蝴蝶结模仿工藤新一的声音给小兰打了电话。
“喂，这里是毛利侦探事务所。”小兰说，柯南变声说：“小兰。”“新一…？”小兰听到新一的声音有些意外，说：“新一没你在哪儿？”新一说：“是这样的，柯南那家伙打电话说今晚他和博士在一起，所以不会去了。”小兰听了说：“是这样啊。新一…”话音未落，柯南挂了电话，叹了口气说：“唉，这样下去怎么得了啊。”灰原哀说：“怎么，女朋友闹矛盾了？呵呵。”柯南打住说：“什么跟什么嘛！无聊。”说完，离开了大厅。
4人走在路上。灰原哀突然变得不正常起来，喃喃：“g、gin…”柯南发觉了小哀的不对劲，问：“灰原，怎么了？”小哀颤抖着，喃喃：“不知道，很熟悉的感觉。仿佛他们就在附近。”一辆轿车吸引了柯南的注意力，“等一下！”柯南阻止了人们的前进，阿笠博士问：“怎么了？”柯南从小巷子的墙角向外瞄了一眼，并没有发现琴酒的保时捷，一个男孩走在大街上，向后瞄了一眼，邪笑着走了，柯南震惊极了，喃喃：“那个男孩…怎么会…难道是…小志？”柯南跟了过去。
几分钟后，柯南跟着那个男孩来到了一个死胡同。柯南笑着说：“最终你还是出现在这里了。”男孩转身过来，笑着说：“呵呵，不愧是高中生侦探-工藤新一，这么快就找到我的容身之处了。佩服。”柯南慢慢向前走着，嘴里说着：“组织的头号通缉犯，原组织成员之一的代号我为-鸡尾酒的田园胜谷的儿子，田园宫志。”男孩笑着说：“好，工藤，既然你能找到我，那么表明那些人也快要找到我了，为了安全起见，工藤，后会无期吧！”说完，男孩扔出一个烟雾弹，‘嘣’一声，白色的硝烟后，男孩不见了踪迹。
回到小巷子。“博士，走吧。”柯南气喘吁吁地说，阿笠博士问：“怎么了？”柯南说：“别管那么多了，也没什么事情。”“那么各位，咱们继续吧。”圆谷明说。4人继续前进着。
“谁！”柯南大喊，感觉有人跟着他们，灰原哀说：“哎，很可能就在附近啊。”柯南跑到路边上，看见一个身影，朝那个身影冲了过去，只听见空中响着一个声音：“黑夜的黎明即将覆盖天空，梦魇的复活很快就要激**内的斗志。”“该死！”柯南四处仰望着，大喊：“你是谁？”不久后，柯南来到了一座桥，只是那个身影已经销声匿迹了。一道紫色的光芒照射过来，柯南望着远处的晚霞，“很美吧？”灰原哀无声般走了过来，柯南嗯了一声：“嗯。”夕阳的落日告一段落，紫色的天空格外艳丽。
（中篇-魔爪瞬间之吻）
回到圆谷明的家。柯南坐在床上，望着窗外皎洁的月光，思考着：“田园宫志，虽然同我和灰原一样都服用了那种名为aptx-4869的毒药。但是，他为什么会在熊本？他随身携带着的那份文件究竟记录了什么？”小哀看见了冥思苦想中柯南，说道：“工藤，或许琴酒他们也来到了这里也说不定哦。”“呃？”柯南哼声说：“很有可能。上次我在江古田追捕怪盗基德的时候，无意中偷听到了琴酒和苦艾酒的通话，他们所说的‘熊本的十字架’直到现在我也不晓得到底隐含着什么意思。”这时候，阿笠博士走了进来，说：“嘿，小哀还有新一！圆谷先生在叫你们呢。”柯南答应了一声：“噢，我们马上就去。”柯南回头对灰原说：“哎，这件事情千万别告诉博士，我怕他知道后反而会无谓的担忧。”灰原哀喃喃：“嗯。走吧。”二人来到客厅。
“哎呀呀！青梅竹马，快来。”圆谷明兴致勃勃地叫道，柯南无奈地喃喃说：“什么‘青梅竹马’，大叔别乱说啊。”灰原哀笑了一声，喃喃说：“呵呵，怎么？”柯南一副无奈的表情，对灰原哀说：“切！”圆谷明拿出了几张cd，说：“这可都是我们家族的辉煌作品啊！像什么《超银河传说》、《超决战贝利亚帝国》、《黑暗的皇帝-亡灵复活》等等，都是巨作啊！呵呵，不知道两位小朋友是否喜欢呢？”柯南拿着这几张cd，高兴地说：“嗯！这可都是日本最近几年火爆的大电影啊，我和我的同学们都很喜欢！”说完转头喃喃说：“我的同学-也就是少年侦探团的那几个家伙。其实他们最崇拜的是假面超人的啦！呵呵…”圆谷明笑着说：“嗯，明天就是发布会了。各位既然都吃饱了，那咱们去散步吧！”阿笠博士提议说：“好诶！听说熊本有座被誉为‘天国之都’的高层建筑，早就听闻大名了，现在刚好可以去见识见识！”柯南听了，喃喃说：“哟，没想到博士还有这个兴趣啊。”
几人离开了家，乘坐公交车来到了熊本县的人吉市。从公交车走了下来，一座高楼大厦伫立于城中央，色彩斑斓的灯光犹如天国的繁华，阿笠博士仰望着那幢大厦，不禁赞叹道：“果然是名不虚传啊！‘天国之都’，嗯，的确够气派！”柯南早已被眼前的事物深深吸引，感叹说：“好雄伟的建筑高楼啊。”圆谷明看了看，笑着说：“哈哈，熊本县壮丽的建筑物多了去了。可是日本著名的旅游胜地啊！”大家走进大厦。“嘿！圆谷导演！”一个前来迎接的男人走了过来，圆谷明介绍说：“哈哈，介绍一下。山崎恋夜，‘天国之都’设计组3d模拟组组长。”山崎恋夜（山崎恋夜：，‘天国之都’设计组3d模拟组组长，51岁，熊本县人吉市人）鞠躬说道：“这位就是圆谷导演常常提起的科学家阿笠博士吧！请多关照。”灰原哀喃喃说：“博士的名气可不小啊。”阿笠博士不好意思地说：“小哀啊，这都是老熟人了。哈哈！”柯南喃喃说：“怎么一个个都是半斤八两啊，真会拍马屁。”山崎恋夜邀请4人到了他的办公室。
电梯里。圆谷明笑着说：“博士啊，好久都没来熊本了，这次可得好好聚聚啊！”阿笠博士笑着说：“多谢阁下的美意咯！那就恭敬不如从命了。”山崎恋夜推荐说道：“今晚大家这么高兴，顺便去试玩我的新软件吧！”博士和圆谷明连声道：“好！！”
电梯到了83楼。大伙走出电梯，朝楼道的左侧走着，“啊，走路怎么这么不小心啊！”柯南被人绊了一下，埋怨说，往回看，两个穿着黑色西装的人朝大楼走廊走了过去，柯南警觉起来，喃喃：“那两个人！”其中一名黑衣人转头过来，柯南目睹了那人的面孔-伏特加！柯南立刻拉住灰原哀的手，并用自己的衣服遮住灰原哀，说：“别回头！这样，你跟着博士他们。你们先走，我稍后就赶过来。如果有什么事情就用 侦探徽章 联系。”说着，柯南向反方向跑了去。灰原哀变得紧张起来，口中一直念叨着：“工、工藤…”
“大哥，一切都办妥了。”伏特加说，“大哥？”柯南躲在墙角处喃喃：“那么另一个黑衣人就是琴酒？他们怎么会在这儿？”琴酒含着一根烟，说：“嗯，现在就等苦艾酒了。”琴酒说道：“那小子逃不掉的。”柯南喃喃说：“琴酒，这次不会让你离开这里的。”柯南拿出 手表型麻醉枪 对着琴酒，琴酒扔下烟头和伏特加一起走进了电梯，柯南有些着急了，心想：“糟糕，他们要离开了！”柯南立刻追了出去，急忙地按着另外一部电梯的按钮，心里着急地喃喃：“可恶！电梯根本不行。”柯南立刻从楼梯口往下跑着……
来到1楼。柯南冲出楼梯，只见琴酒他们走出了大门，柯南飞一般冲出大厅，街道上数不胜数的车辆挡住了视线，柯南焦急地四处张望着，终于看见琴酒和伏特加坐进了那辆黑色的保时捷轿车里，一会儿便开走了。远远望去，柯南站在路旁。“最后，还是让他们逃掉了。”柯南喃喃着：“到底…组织策划着什么阴谋？苦艾酒、琴酒…为了什么出现在这栋大楼？”柯南立刻原路返回，回到83楼。
黑色保时捷内。驾驶车子的伏特加对坐在副驾驶座位上叼着烟杆的琴酒说：“大哥，咱们为什么非要按照苦艾酒的计划做？反正都是为了那个家伙-田园宫志，我们自己行动不就足够了吗？”琴酒挪了挪帽子，说：“呵呵，这你就别管了，照她说的做就行了。真是踏破铁鞋无觅处得来全不费工夫啊，没想到那个女人也在这儿。”伏特加疑惑了，问：“谁？”琴酒斜笑着，说道：“那个背叛了组织的贱女人。呵呵，你可想死我了，雪 莉…期待咱们再次重逢吧。”说着，琴酒手中拿着几根褐色的头发和一张宫野志保的照片。“那太好了。”伏特加说：“这么一来不就一箭双雕了嘛，哈哈，果然不愧是大哥啊。”琴酒笑着，喃喃：“雪莉…我真想立刻看见你坠落死亡低谷时那苍白恐惧的样子。呵呵！”那辆黑色的保时捷朝着月光的方向行驶……
（下篇-天国、地狱的计时）
大楼。大家看着气喘吁吁地柯南，阿笠博士不禁问起；“怎么了，新一？”柯南喘了口气，喃喃说：“没什么，只是刚才去了趟厕所。”这时，灰原哀走了过来，小声说：“哎，工藤，他们…真的徘徊在这附近？”柯南回答说：“不知道，我只看见他们离开了人吉市，应该是去和苦艾酒回合了吧！因为我刚才偷听到了琴酒和伏特加的对话，说道‘现在就等苦艾酒’，我想他们的计划已经开始执行了，但到底是什么我却一无所知，就连‘熊本的十字架’我都还没有参透，还有，就在我们回去的路上，我看见了 田园宫志，我想琴酒他们就是为了他而来的，因为据我所知，田园宫志手中有关于组织所说的boss的机密的文件。组织这么折腾，就是为了夺回那份文件！”“b、boss…”灰原哀愣住了：“那个人！aptx-4869的成分记录，我想文件的内容就是这个！”柯南大吃一惊，私下思考着：“如果真是灰原所说的那样，那么服用过那种药物的田园宫志…他之所以窃取那份文件，难道是要做那种事吗？”“嘿！”圆谷明打乱了二人的谈话，喊道：“青梅竹马嘀嘀咕咕的说些什么呢？”柯南立刻变了脸，嘻嘻说：“呵呵，没有啦！圆谷先生您听错了吧，是吧，灰原？”灰原哀隔了好久才吭声道：“呃？哦~嗯。”圆谷明笑着说：“哦，原来如此。那么现在就请二位试玩一下山崎老弟的新软件吧！”柯南和灰原两人被迫推向软件的面前，柯南目瞪口呆地看着软件，喃喃说：“这、这都是些什么啊？”一旁操纵仪器的山崎恋夜说：“呵呵，二位进入座位套件吧。”柯南和灰原分别进入了两个椭圆状的机械里，只见山崎恋夜拉下操纵杆，‘咔呲’几声，柯南和灰原眼前一片茫然，几分钟后，机械门打开了，两人昏昏沉沉地走了出来，柯南喃喃道：“搞什么嘛。”阿笠博士笑着说：“嘿呀，新一啊，感觉不错吧！这可是山崎先生的最新创作软件啊，它通过人物照相辨别指纹、相貌，进行数码分解、再融合，形成一个3d模式版的动态系列游戏。”这时山崎恋夜走了过来，悄悄对柯南地说：“其实，这部软件的额外功能还能通过实验者人体散发出的静电荷通过电脑分析，就可以得到几年后实验者的未来照片噢。”柯南听了愣了一番，心里有些着急了，自言自语说：“完蛋了！要是电脑分析出我和灰原辨别出未来时候的我们的照片的话，那就糟糕了！”山崎恋夜笑着说：“我倒要看看你们两个的将来模样是什么样子，哈哈哈！”一会儿，山崎恋夜走到控制仪面前，却发现仪器屏幕上呈现‘数据紊乱，无法辨别’的字幕，“搞什么？”山崎恋夜喃喃说，一旁的圆谷明问：“怎么了，山崎老弟？”山崎恋夜答应说：“噢，没什么。试验品终究还是试验品，没有能辨别出这两位小朋友未来的样子。呵呵，不好意思，让大家的心思落空了。”阿笠博士拍着山崎的肩膀，说：“没什么，我也经常实验失败嘛。”“呵呵…”柯南松了口气，灰原走到柯南身边，小声说：“也许是将来我们都已经不在这个世界上了呢。”柯南愣了一下，差点吓住了。
“刚才那辆保时捷还真是罕见哎。”这时两个工人路过办公室说着，柯南走到工人面前，问：“什么！你们有看见保时捷的车子？”一个工人说：“嗯，就停在大楼对面的停车位上，好像是车牌号为4368的黑色保时捷，那种50年前的车子现在竟然还能够看到，真是奇迹啊！”“4368！”柯南喃喃着：“错不了的，就是他们！”柯南跑到窗户，打开追踪眼睛的望远功能向下俯视，看见一辆黑色的保时捷停在大楼对面的一幢废旧楼层的门前。“到底，他们在哪儿？”柯南心急如焚地看着对面的楼层，四处寻找琴酒一伙人的身影。
废旧楼层顶楼。琴酒举着一架机关枪、抽着烟，说：“准备启动那里面的炸弹，伏特加。”“是，大哥！”伏特加拿出了遥控器，琴酒说：“呵呵，该你登场了。说吧，接下来该怎么做？”“接下来…”一个女人从楼道慢慢走了过来，说：“等。那小子应该收到了我发出去的东西了。接下来就守株待兔，猎物自己会上钩的。呵呵…”琴酒喃喃说：“呵呵，苦艾酒，你还真是胸有成竹啊。”“哈哈哈！琴酒，你也会说‘胸有成竹’？”苦艾酒笑着说：“以往组织的人物不是一向有你负责的嘛！废话少说，伏特加，监视好对面的大楼，‘天国之都’的称号我喜欢。”
一天前：苦艾酒用电子邮件发送了一封信函。苦艾酒坐在椅子上，看着桌前的照片，口中喃喃说：“田园宫志…谁叫你先背叛了组织呢。”某个地方。田园宫志收到了信函，点击阅读-鸡尾（田园宫志的父亲-田园胜谷在组织里的代号）次子，关于你的父亲，我不会向组织汇报，但是条件是明天晚上到‘天国之都’内，再商谈合作。署名-赤井秀一（英文名字：akai syuuichi或akai shuichi。身份：fbi搜查官 同时也是fbi对付组织的王牌 。曾是组织的一员，组织代号：rye<黑麦威士忌>。最后被琴酒暴露了fbi的身份，被组织称为“银色子弹”）
废旧楼层。苦艾酒回忆说道：“当时我还以组织代号-rye的赤井秀一的名号署名呢，呵呵，相信那家伙凭借之前他父亲和赤井秀一的关系，他会来的。”琴酒说：“赤井秀一？称之为‘银色子弹’的男人。苦艾酒，你还真是用心良苦啊。”苦艾酒笑着说：“若不是为了boss，我能这么大费周折吗？那份文件，是绝对不能够向外暴露！否则，组织就会暴露于世界！虽然我并不是很在意这些。”琴酒叹息了几声，说：“呵呵，你是怕组织一旦暴露你在国际地位也会不保吧，就连你在美国明星的头衔都会一扫落地。真不知道为什么这些年来，会有背叛组织的叛徒？雪莉…”“大哥，那女人也在吧。”伏特加说，琴酒吐开烟头，说：“呵呵，当然，她的气息我再熟悉也不过了……就让这场风暴变得更残暴吧！”
大楼83楼。柯南突然回忆起，说道：“琴酒出现在这栋大楼，目的难道是为了找出田园宫志？既然没有找到，为什么当时伏特加说‘一切准备妥当’？这群乌合之众到底要干什么！”‘嘀嘀……’似乎很微渺的声音回荡在楼道上，柯南听到了声音，猛地想起，说：“这栋大楼……被、被安装了炸弹！？糟了！”柯南急忙跑到办公室，大声喊着：“快！大楼被安装上了炸弹！快离开！”所有人惊骇得站立不住，山崎恋夜立刻用计算机转播到大楼的广播室，对着话筒喊：“所有人注意！立刻离开大楼！重复，离开大楼！”说完几人急忙地从楼道跑下楼，柯南边跑边想：“炸弹，在哪里？！要是引爆的话，整座大楼就会灰飞魄散，就算逃出大楼，这附近几十里也会受到爆炸的影响的。而且现在不可能向方圆几百里的所有居民通知紧急逃离的讯息。”“工藤。”灰原说：“要是这颗定时炸弹，我想是冲着田园宫志来的。”“不。”柯南反驳说道：“很有可能他们发现了你。现在管不了这么多了…”
“那个人…”柯南视野的余光看见了一个穿着皮夹克的男孩躲在楼梯道的门后面，“雪莉…”一个声音突然响起，灰原震住了，回头一看，一个男孩对着自己笑着，说：“好久不见。”
灰原不禁喃喃：“田、田园宫志……”
大楼倒计时，存亡的刹那间。
下集预告：‘天国之都’陷入危机，爆炸的几率持续上升，通往天国的打击时已经拉响……田园宫志的出现、直面组织的爪牙、杀气重重的氛围中一个男人位于中立，柯南身份面临暴露的危险，工藤新一的身份是否会榜上有名！浩劫随时引爆。这天的夜晚，格外的‘鲜红’，下集《柯南》-《与黑暗组织的再会*第二弹·工藤新一》
