内容前景：fbi组织的宴会中，柯南不幸失足昏迷，竟然发展到失忆的地步！临瑟穴粒与柯南的失踪，众人纷纷兵分两路，夜深人静之际，意外间，工藤新一再度重归；另一方面，宴会中，水无怜奈的嘀嘀-本堂瑛佑现身。钢琴的旋律潮起潮落，不能回头的二人目光重重！星期六的推理依旧悬疑。柯南失踪案件演变强盗犯犯罪事件，兵分两路的众人该如何面对？瑛佑此行的目的究竟是什么？工藤新一回来了，小兰充满失望的忧伤…唯一看透了真相的是一个外表看似小孩，智慧却过于常人的名侦探-柯南！！
（上篇-新一的失忆&本堂vs世良，推理的对决）
“不对，一定还来得及！”小兰默默喃喃着：“柯南~”
很快，詹姆斯及佐藤警官来到了仓库，佐藤警官封锁了仓库现场。众人再度前行。
小兰等人赶上了世良真纯。“世良，到底该怎么办？现在我左右为难不知道该怎么做。”小兰叹息着，世良对着小兰说：“振作点，小兰！柯南肯定还在附近！不要放弃希望啊！可恶，到底仓库内幕发生了什么，那团血迹究竟是谁的？”茱蒂走了过来，说：“詹姆斯已经联系日本警方，相信犯人不会出没在这一带。”卡迈尔说：“茱蒂，你不是有柯南的手机的信号么？”茱蒂恍然大悟，立马拿出手机追踪柯南手机的坐标，结果令人惊讶。小五郎问：“怎么了吗？你怎么一副吃惊的表情？”茱蒂说：“信号就在附近，不，就在前面20里！”
“什么！”小兰惊讶道，连忙望着前方，只见一个身影慢慢走来，颤巍巍的。“信号消失了。”茱蒂说，世良惊叹：“消失了？！开什么玩笑！”莱城说：“该不会男孩的手机被犯人发现了吧？”园子担忧道：“那不是说小鬼现在处境非常危险？！”小五郎说：“不要胡思乱想了！柯南说不定现在还没有生命危险，我们还是继续寻找吧。”于是众人继续搜寻着。
众人离黑影越来越近，越近，小兰的心情就越担忧，仿佛很熟悉的身影~
终于看见了黑影的面貌了，黑影背对着众人，蹲坐在石板上。小兰半信半疑地走上前去，看着那个人，竟然是工藤新一！
“新一！”小兰不禁喊道，便扑倒新一怀中，“新一？！”众人纷纷诧异，走到男人面前一看，果然是高中生侦探工藤新一。瑛佑诧异了，吃惊道：“工藤新一？！柯南~变回高中生模样了？怎么会…怎么么回事？”莱城看着新一，喃喃说：“他就是那个高中生侦探的工藤新一？”众人大吃一惊。小兰连忙问：“新一你怎么会在这里？对了，你看见柯南了么？”新一默不作声。园子一手逮住新一的衣领，说：“你这是什么态度啊！没听见小兰在问你吗？！你在想什么？”
“我是谁~？你们是谁？”只听见新一细腻憔悴的声音，大家愣住了，小五郎说：“没搞错吧，你也失忆？！”小兰半信半疑，拉住新一的手，看着新一的眼睛，说：“喂！好好看看，就连我也想不起来么？新一！”新一看着小兰，微微摇头，喃喃说：“你，你是谁？”
世良一手拉住工藤，大喊：“你是工藤新一？要是的话就赶快告诉我们！现在时间紧迫！”“工藤新一？我是工藤新一？”新一喃喃着，小兰愣住了，摇着新一的肩膀，说：“这不是真的，新一，一定是像那次一样装失忆，对吧，新一！你快回答我！”新一哑口无言。
卡迈尔说：“虽然现在柯南应该还没走远，现在追的话应该会被犯人发现。”“到底，柯南和临瑟穴粒为什么要离开？”茱蒂绞尽脑汁喃喃着。
“呃我觉得柯南和那位大叔走不远的。”瑛佑说道，园子问：“why？你咋知道？”世良看了看四周的脚印，说：“我也这么觉得，这里的脚印复杂混乱，而且…”说着，世良蹲了下来用手指蘸了沉淀在杂草上的血迹，嗅了嗅，接着说：“血迹，应该是刚才仓库内的受伤者的血液。而且，要是犯人还在附近，柯南他们肯定不会打草惊蛇地逃之夭夭，而且，柯南来到仓库应该是有人通报了埋伏在仓库附近的同伴，所以犯人才会这么精确地发现柯南的踪迹。”
瑛佑说：“但是，那个临瑟穴粒先生呢？真的和柯南在一起？”大家沉思了。
“新一！”小兰呐喊着，工藤神色自然却默不作声。小五郎走到工藤面前，气哄哄地数落：“侦探小子！你想干嘛啊~问你话呢，听见了么！”工藤闭着眼睛。小兰愣住了，失望地回头，朝着草地的血迹方向走去……
茱蒂看着工藤新一，叹息了，这时，莱城提示道：“大家听我说，会不会柯南和临瑟穴粒先生在临瑟穴粒的家里？”话音刚落，大家惊讶地看着莱城，卡迈尔说：“很有可能！茱蒂，你认识临瑟穴粒，应该知道他居住的地址才对。”茱蒂说：“那就，走吧。”茱蒂带着大家去了爱知县名古屋市中川区立野町。
立野町。一路上，小兰陪伴在新一身旁。
“到了，立野町立野站。”茱蒂说，莱城说：“走吧。”“不需要通知临瑟穴粒先生么？”卡迈尔问，世良和瑛佑斜笑着说：“不用。尘封的谜底即将揭晓~”“原来是这样，他是这个意思啊，呵呵~”世良自言自语着。少年侦探团的几个小孩感到莫名奇妙，小兰说：“世良同学，那现在该怎么办？”世良低着头只是笑着。
小五郎心急如焚地看着难过不安的小兰，小兰一直望着新一的眼睛……
工藤突然放开小兰的手，跑开了，小兰追赶着，大喊：“新一，你要去哪儿？新一！”大家看着远去的新一，渐渐的，工藤新一的身影越来越模糊不清，消失在了月光的尽头。
（中篇-强盗犯vs临瑟穴粒）
临瑟穴粒在扔下柯南还停留在废旧仓库附近的车站中。临瑟穴粒望着仓库的方向，喃喃着：“那个男孩，他、他竟然会……”说着，临瑟穴粒回忆着坐在计程车内：
计程车内。司机问：“先生请问您要到哪儿？”后座上的临瑟穴粒说：“去…”还未说完便迟疑了一会儿，看着身边熟睡的柯南，对着司机说：“噢，到前面的废旧仓库吧。”于是司机改变方向，朝着废旧仓库驶去了。
“小鬼太烦人了，接下来只能靠我自己去了！”临瑟穴粒喃喃着，说着便坐上了去往立野町的动车。
动车内。临瑟穴粒坐了下来，“叔叔，带上我吧~”一个幼嫩的声音叫住了临瑟穴粒，临瑟穴粒睁开眼，竟然是柯南站在自己面前，临瑟穴粒震惊极了，柯南便坐在临瑟穴粒旁的位置上。动车行驶中，临瑟穴粒目不转睛地盯着柯南。柯南说：“不好意思，我上个厕所！”说完，柯南朝着厕所间跑了去。
立野町立野站附近的胡同里。“喂，搞定了没？”近帘步申对着对讲机喃喃着，对讲机传来女人的声音：“那小子死活不肯交出密码，对了，他身边还有个小孩。‘幽灵’，你说该怎么办？”“小孩？！”近帘步申惊讶道：“‘魅炎’，仓库那边警视厅一定已经封锁了现场吧~”“嗯。”女人回答：“现场除了那男人的血液外没有留下什么。”说着，近帘步申便中断了通讯，看着驾驶座上的反光镜，嘴角一咧，斜笑着说：“临瑟穴粒，呵呵~还在做无谓的症状么。”
女人放下对讲机后，拿出了雪茄，看着桌上的咖啡杯，突然发现自己脚腕出的异样，便脱下靴子一看，竟然是卫星定位器！女人回忆着：
废旧仓库。只见临瑟穴粒捂着左臂忍耐着疼痛，被枪声吓醒的柯南连忙害怕，不小心从木椅上摔了下来。女人看着狼狈的临瑟穴粒，笑着退隐了。其实，柯南摔了下来，趁人不注意偷偷把卫星地为其定在了女人的靴子上。
“原来是这样。”女人回忆着喃喃：“小鬼~干得不赖嘛，呵呵~戴眼镜的男孩。”说着，女人讲卫星定位器捏碎了，将粉末撒进了咖啡杯里。
立野町。大家各自站在不同的位置，世良盯着本堂瑛佑，园子则安慰着小兰，茱蒂一直在联系着詹姆斯。“总不能就这么干等下去吧！”卡迈尔说，“耐心点。”莱城平和地说着，小五郎说：“切！你们这么做有什么意思？要是对方不来呢？”“一定会来的。”世良喃喃道：“等着瞧吧，不仅是他，而且还有别的人。”元太左右看了看，疑惑道：“光彦，灰原呢？”光彦也四周看了看，说：“好像一路上没见到灰原哀。步美，你知道吗？”步美摇着头，猜测道：“会不会是先回博士家了？现在柯南失踪了，连新一哥哥也不闻不问地离开了。”
‘飒’一声，一个黑影从上空飞过，世良警觉到了，立即仰望着夜空，谨慎道：“小心，有人！”大家纷纷警示起来，只见从上空慢慢散下偏偏花瓣随风飘荡，小兰接住一片花瓣，说：“是樱花。”“到底是什么人？”园子疑惑道。那个黑影再次从附近闪过，茱蒂说：“卡迈尔，雷达探测！”卡迈尔连忙拿出探测仪，说：“附近有什么人在迅速移动。”
到底~是谁？
小五郎指着夜空，惊恐道：“喂喂，大家，看！那是什么？！”大家抬起头，只看见一颗高大的树枝的高处站着一个黑影，黑影背对着众人。瑛佑仰起头，眼前的一幕惊呆了，顿时手脚不听使唤地摔倒了，喃喃道：“那个身影~难道是……”“基德大人！！”园子激动道：“一定是怪盗基德！”
“你到底是谁！”世良站了起来，大喊道，黑影慢慢转过身来，伫立在高处。人们看见一个穿着黑紫交织的西装、戴着一顶黑紫色的绅士帽、佩戴者红色领带以及戴着一副遮住了上半脸的白色面具。“等等，那个人！！”小五郎惊讶道，园子也跟着起哄：“就是他！绝不会错的！是…”小兰仰望着高处，喃喃：“黑暗骑士~”
“黑暗骑士？！”世良惊起，说：“他是谁？黑暗骑士！”“原来如此，上次网络上播放的特别节目-《千年难遇日全食，潘多拉魔术之争，怪盗基德vs黑暗骑士》(本作品第十九集《黑暗骑士》)？！”瑛佑惊讶道：“他就是‘暗黑下的支配者’黑、黑暗骑士？！”
世良愣住了，喃喃：“黑暗骑士……基德~那次的决战！总算是见到本尊面目了！”黑暗骑士轻松一跃，倒立下落，只见‘封’的一声，滑翔翼展开，黑暗骑士消失在了月光之中。
停在立野站附近的货车也有所行动了，近帘步申拿起对讲机说：“‘魅炎’，该出动了~傻子来了。”女人接收到后也走出家门。
“各位乘客，下一站-立野站，需要下车的乘客请做好下车准备。”动车广播发出声响，临瑟穴粒便站了起来，当动车停站后，临瑟穴粒四处望了望，喃喃：“小鬼不在~哼！不会让你们得逞的，‘幽灵’！‘魅炎’！”说着就下车了。
（下篇-cia的对决）
不一会儿，动车便启动离开了立野站。临瑟穴粒朝着居住所走了去。
“快跟上他！”世良大喊：“本堂和莱城先生、茱蒂老师、小鬼们留在这里继续等待！其他人跟我走！”说着，世良带着小兰、园子、小五郎和卡迈尔朝着黑暗骑士飞走的方向一路狂奔。
几分钟后。“莱城先生。”瑛佑喃喃着，莱城说：“哦。”说完，二人趁不注意便悄悄走到了附近的树林里。
树林里。本堂瑛佑停住了脚步，莱城说：“本堂是吧，什么事？”“莱城先生，是那个吧~”瑛佑敲着树木的枝干说，莱城镇住了，说：“你在说什么？”瑛佑说：“就是cia啊。”二人沉浸在寂静的树林中……
立野町。近帘步申开着货车火速追赶着目标。另一方面，临瑟穴粒也接近了目的地。
世良等人一路跟着黑暗骑士的方向，互不相干的众人慢慢汇聚在同一地点。
树林里。“c、cia？！”莱城愣住了，说：“呵呵，为什么这么认为？”瑛佑说：“宴会上，当柯南醒过来是，莱城先生你接近了柯南吧~”“有什么关系？”莱城说：“不会吧，你是…伊森……”“是的，几年前cia派遣进行神秘任务的伊森·本堂，我是本堂瑛佑，他的儿子！莱城先生知道我爸爸！cia这个组织我的确很想加入，为了我最重要的某个人~”瑛佑喃喃道：“没想到，在这里还能碰到爸爸的同事。拜托了，莱城先生！拜托告诉我那个计划，就是我爸爸执行的那个计划！”莱城坦白道：“没想到就是在试探小男孩是否说谎的时候被你看穿了，cia的惯用手法。呵呵~”“对了，说不定茱蒂老师那边有情况了！我们回去吧。”瑛佑说，于是，二人回头走去了。
“事情绝不是你所想的那么单纯，‘本堂’。真的~你绝对猜不透的结果……”莱城默默地自语着。
“差不多可以了吧~”一个熟悉的声音回荡在夜晚中，黑暗中，一个拿着变声蝴蝶结的阴影，将变声蝴蝶结靠在自己嘴前，说：“这件事也该结束了~最后的审判！”
下集预告：强盗犯正式登场！江户川归来，黑暗骑士&柯南&新一的推理，结局大吃一惊！世良与小兰，武术联盟劲爆！最终的真相水落石出。下集《柯南》-《f&c&o3》《粉红的菜单》
~等待的最后答案，需要守护不变的执着~
